要想发挥种蛋的最佳孵化潜力，生产高质量的一日龄雏鸡，需要对种蛋进行多次而有效的收集，及时、正确的进行消毒、冷却、储藏和孵化等环节，其中任何一个环节做不到位都能损害胚胎的发育。
　　种蛋卫生与否直接影响着孵化效果，如果种蛋太脏不经处理就上孵，会造成雏鸡早期细菌感染，会在孵化过程中形成臭蛋，臭蛋一旦破碎会使周围的种蛋受到污染，而影响孵化率，增加成本降低效益，因此种蛋的卫生对孵化至关重要。现从以下几点来谈一下如何收集干净而卫生的种蛋。
　　一、产蛋箱的设计、摆放、卫生及管理
　　产蛋箱通常为2层，每4只母鸡一个产蛋窝，一个产蛋窝的尺寸大约是宽30cm深35cm高25cm，产蛋箱的设计应考虑通风良好，并且无贼风，底层产蛋箱的进出踏板距地面高度不应超过15cm，而且应比第二层产蛋箱的进出踏板向外超出至少10cm，这样有助于种鸡能顺利进入第二层产蛋窝里去。
　　产蛋箱一般在20周左右放入鸡舍内，产蛋箱一般1/3放在棚架上，2/3放在棚架外，用砖块或支架钢丝等固定，产蛋箱一般要摆放均匀、牢固。如果不牢固，鸡上产蛋箱时，会使蛋箱晃动而使鸡受到惊吓，而不在产蛋窝内下蛋，从而增加地面蛋的数量，而使脏蛋增加。产蛋箱固定好后，里面放入松软干净的刨花或稻壳。起初把下层关闭，把上层打开，训练鸡只进入上层蛋窝下蛋，见蛋后再把下层打开，蛋窝内的垫料每周最少添加两次，从而减少种蛋的破碎率。
　　蛋窝内和蛋箱外的卫生也至关重要，蛋箱顶层，每天加完料后，都要用干净的笤帚清扫或用蘸有消毒药的抹布进行擦试，防止上面沾有太多灰尘；在进行带鸡消毒时，注意不要让脏水流入蛋窝而污染种蛋；每天要把蛋窝内的碎蛋及鸡粪及时清理出去，减少种蛋污染；每晚要把产蛋箱顶部及窝里的鸡放到地面上，把蛋箱门关死，不让鸡在产蛋箱顶部及窝里过夜。
　　二、减少地面蛋的数量
　　脏蛋的来源大部分都是地面蛋，要想减少地面蛋从以下几个环节做起：
　　1.设计产蛋箱时应有合适的进出踏板，底层踏板不要高于地面垫料45cm，底层踏板宽超出上层至少10cm。
　　2.产蛋箱放入鸡舍后，饲养员要来回不停的在鸡舍内走动，尤其是鸡群开产后要增加走动次数，把在地面上下蛋的鸡及时抱入产蛋箱内。
　　3.见到第一枚种蛋以后，将5-7天之内所有产的蛋都放入产蛋箱，吸引母鸡进入产蛋窝。
　　4.要把产蛋箱底部用塑料网等围起来，因为蛋箱底部光线暗，鸡比较喜欢进去下蛋，底部用塑料网围起来，除了能减少地面蛋外还能避免鸡躲在下面，而影响光照刺激及受精率。
　　5.要及时收集种蛋及增加捡蛋次数。及时收集种蛋不仅能保持种蛋的卫生，还能减少母鸡对产蛋箱内种蛋的损伤。种蛋应每天定时收集，每天至少六次，一般上午三次，下午两次，晚上一次，每次收集的种蛋数量不能超过全天总产蛋数的30%。
　　6.每天捡种蛋前都要用消毒液洗手，种蛋最好收集在专用的蛋盘内，最好不要把种蛋放在桶内或篮筐内，避免种蛋破损和相互污染。捡蛋时最好把干净的种蛋和脏蛋分开放，同时使用滑车时，要防止鸡跳上滑车，而打翻种蛋。
　　三、为减少地面的脏蛋，还必须使地面的垫料干燥松软
　　这就要加强产蛋期垫料的管理，必须加强通风，每天对垫料进行翻动，及时清除结块和潮湿的垫料来减少脏蛋的数量。