鸡球虫病是一种对养鸡业危害很大的原虫病，集约化养鸡业尽管受到鸡球虫病的严重威胁，几十年来仍能健康发展，这完全得益于抗球虫药的保护。目前，控制鸡球虫病的主要手段仍然是依赖于抗球虫药的防治。由于抗球虫药的长期使用导致了球虫对多数抗球虫药产生了耐药性，球虫耐药性的产生，导致抗球虫药使用年限缩短，防治失败或效果不佳，引起临床或亚临床鸡球虫病，造成巨大的经济损失。此外抗球虫药的使用还存在用药程序的不合理以及盲目用药等问题，严重影响到抗球虫药的抗球虫效果。下面就鸡球虫病药物防治时存在的问题及对策做简要介绍：
   
　　1 存在的问题
　　1.1 用药环节
　　1.1.1 盲目用药。我国大多数的中小型饲养场主缺乏对抗球虫药的基本常识的了解，导致盲目采购抗球虫药进行预防和治疗，另外绝大多数家禽饲养者，在缺少田间监测和敏感性检测的情况下，仅凭个人的肉眼观察和饲养经验选择抗球虫药进行预防和治疗。在市售的所有抗球虫药中，大约有80%的抗球虫药产品在产品标签和说明书上无法获知该产品的原料组成，导致家禽饲养者盲目用药和重复用药，增加了中毒和产生抗药性的风险。
　　1.1.2 剂量不准。饲养者或部分饲料厂在使用过程中任意加大剂量，甚至3～4倍量已经成为普遍现象。这其中客观存在着某些市售抗球虫药物剂量不足的原因，另外由于抗药性的存在使抗球虫药达不到预期的预防和治疗效果也是导致加大剂量的原因之一。抗球虫药使用不当会导致药物剂量不准，例如三字球虫粉使用过程中对水酸碱度的要求，碱性水会造成溶解度的下降而析出;饲料加工过程中抗球虫药混合不均匀;白羽肉鸡的推荐剂量使用在黄羽肉鸡上，却忽略了黄羽肉鸡与白羽鸡采食量的不同。
　　1.1.3 注重治疗，忽视预防。在养殖现场，许多养殖户忽略了球虫预防的重要性，单纯从投药成本来判断预防和治疗的可行性。在田间发现血便等临床症状时，实际上球虫已经接近完成了无性繁殖进入有性繁殖期，此时用药为时已晚，只能起到抑制球虫进一步发育和预防后续感染，保护未感染的鸡，造成的损失已无法挽回。而且在出现临床症状后，由于饮食能力的下降，无论是拌料给药还是饮水给药，实际都难以获得足够的药物剂量。因此，雏鸡到了易感日龄应该使用球虫药进行预防。特别是在易感阶段和流行季节更要进行预防。
　　1.2.抗药性
　　1.2.1 产生抗药性的调查。20世纪60年代，对抗球虫药有抗药性的虫株相继出现。目前由于抗球虫药的普遍长期使用，田间分离的球虫卵囊表现出对抗球虫药抗药性的复杂化，主要表现在多重抗药性和交叉抗药性。例如球虫对离子载体类抗球虫药就存在交叉抗药性问题，但并不是化学结构相似的抗球虫药之间均能产生交叉耐药性，例如地克珠利和百球清虽在化学结构上十分相似，但两种药物并不存在必然的交叉抗药性。
　　1.2.2 耐药性的特点
　　1.2.2.1 耐受高浓度的抗球虫药。对绝大多数抗球虫药来说，在防治鸡球虫病时，球虫一旦对某种药物产生了耐药性，它便可耐受其连续使用浓度的4～8倍甚至更高的浓度;此时再提高药物浓度，它又可耐受此浓度的4～8倍甚至更高的浓度，而实际生产上这一浓度足以对鸡群本身造成毒害作用。喹啉类药物曾为防治鸡球虫病的优良药物，任何一种喹啉类化合物以40mg/kg剂量连续使用，可完全抑制球虫的增殖，然而获得耐药性后，即使是用1000mg/kg以上的剂量也完全无效。
　　1.2.2.2 具有多重耐药性。多重耐药性又称复合耐药性，鸡球虫具有对两种或两种以上化学性质各异、作用方式不同的抗球虫药同时或先后产生耐药性的能力。这种多重耐药性不仅可在实验室通过耐不同单一药物的虫株之间进行杂交获得，而且从田间分离的虫株也同时具有对2～4种药物的耐受性。Jeffers（1981）报道过对氨丙啉、氯羟吡啶、癸氧喹酯、尼卡巴嗪耐受的虫株。
　　1.2.2.3 具有交叉耐药性。鸡球虫的交叉耐药性主要表现在，当球虫对某种抗球虫药物产生耐药性的同时，也会对从来未接触过的同类药物产生耐药性，这种耐药性往往出现于化学结构相似、作用机理相近的药物之间。Bedrinik （1989）等报道过对单价离子载体抗球虫药失去敏感性的虫株，对除马杜拉霉素外的其他单价离子载体类抗球虫药也耐受，而对二价的拉沙里菌素敏感。
　　1.2.2.4 具有遗传性和相对稳定性。耐药性是通过耐药基因而遗传的。实验中先只使裂殖子获得耐药性，裂殖子能将这种耐药性传递给进行世代交替的卵囊。获得耐药性的虫株，分离后保存在实验室中，可长期保持这种耐药性。