消毒是用物理的、化学的和生物的方法杀灭病原微生物。其目的是预防和控制传染病的发生、传播和蔓延。大型养殖集团因有较为完备的实验室，完善的管理措施和雄厚的技术力量，能够科学的选择消毒剂，检验消毒剂的质量和在现场使用后的实际消毒效果，使消毒工作达到理想的效果。而广大的养殖场(户)面对销售商上百种消毒剂的名称，品牌无法正确选择消毒剂，更无法检验消毒剂的内在质量和实际使用效果，本文按消毒剂的作用机理就如何正确选择和使用消毒剂，谈一点看法，供大家参考。
一、通过分子碰撞原理，即通过消毒剂分子碰到病原微生物杀灭病原微生物：这类消毒剂的配比浓度越高，消毒剂分子就越多；温度越高，消毒剂分子运动越快；环境中有机物越少；消毒剂分子碰到病原微生物机会就越多，消毒效果越好。具体使用时，须注意配比浓度(酒精则以75%最好)、环境温度和环境中有机物浓度。
(一)通过分子碰撞原理，使病原体蛋白质变性、发生沉淀的消毒剂：这类消毒剂的作用特点是杀菌、杀病毒无选择性，可损害一切生命物质，属于原浆毒，消毒过程中可破坏宿主组织，即对猪、鸡有毒性，会引起畜禽应激，会污染环境，破坏设备。此类消毒剂仅可用于空室、环境消毒，绝不能带鸡带猪消毒。如酚类、醛类、强酸强碱类等。
1.酚类消毒剂：石炭酸、来苏儿、煤酚、苯酚、复合酚等具有臭药水味的一类消毒剂：这类消毒剂商品名最多，其中苯酚对芽胞、病毒无效，复合酚含41-49%的酚和22-26%的醋酸，是其中消毒效果最好的，此类消毒剂因其具有特别的药臭味，又具原浆毒，吸入皮肤有至癌性，常用于消毒池和排泄物的消毒，很少用于空室消毒，更不能带鸡带猪消毒。具体消毒时须先把环境冲洗的干干净净，浓度要达到0.5-1%以上，温度不能低于8。C，消毒效果才好。禁止在碱性环境或同碱性溶液及其它消毒液混合使用。
2.碱类消毒剂：烧碱、生石灰等，常用2-3%烧碱加10-20%石灰乳消毒及刷白畜禽场墙壁、屋顶、地面等，假如配制烧碱溶液时提高温度、加入食盐消毒效果更佳。用烧碱液消毒时应注意防护，消毒畜禽舍地面后6-12小时，应再用清水冲洗干净，以免引起畜禽肢蹄、趾足和皮肤损害。生石灰是价廉易得的消毒药，许多养殖场喜用干石灰粉进行消毒，这是错误的。石灰必须在有水份的情况下才会游离出OH-离子而发挥消毒作用，干石灰粉因可以从空气中吸收CO2变成碳酸钙而失去效果，所以不能用干石灰，石灰不能久存，畜禽场门口、墙角、地面应用20%现配的石灰乳消毒，消毒才有效。
3.醇类消毒剂：用75%酒精，一般用于消毒注射部位。
4.醛类消毒剂：甲醛(福尔马林)、戊二醛，甲醛是最好的熏蒸消毒剂，熏蒸消毒必须有较高的室温(高于18。C)，相对湿度为70%左右才有效，低于15。C甲醛很容易聚合成聚甲醛而失去消毒功效，甲醛气体消毒穿透力较差，应把物体特别是垫料尽量散开，福尔马林长期贮存或水份蒸发后会变成白色多聚甲醛沉淀，从而失去消毒效果，需加热至100。C才可又变成甲醛。甲醛有致癌性，出口鸡严禁使用。戊二醛常用其2%溶液，消毒效果好，不受有机物影响，若用0.3%碳酸氢钠作缓冲剂，效果更好。但戊二醛价格贵，稳定性差。
二、通过分子碰撞原理接触病源体，干扰病原体的重要酶系统，影响菌体代谢的消毒剂：主要有氧化剂和卤素类消毒剂。此类消毒剂是通过氧化还原反应损害细菌酶的活性基因或因化学结构与代谢物相似，竞争或非竞争性地同酶结合，抑制酶的活性，引起菌体死亡。高浓度时具一定毒性，可用于空室消毒，也可带鸡消毒。
1.氧化剂类消毒剂：过氧乙酸、高锰酸钾，过氧乙酸又名过醋酸，有强烈的醋酸味，性质不稳定，易挥发。最好用市售20%浓度、在半年内生产的。现用现制现配，对霉菌和芽胞均有效，因其对组织有强烈的刺激性及腐蚀性，很少用于带猪消毒，因猪的嗅觉极其灵敏，带猪消毒常引起猪的应激。一般用量0.1-0.5%。高锰酸钾常与甲醛溶液混合用作熏蒸消毒。过氧乙酸、高锰酸钾在酸性环境中作用力强，不要在碱性环境中使用。
2.卤素类消毒剂：
(1)氯化合物：漂白酚(次氯酸钠溶液、漂粉精)、氯胺、二氯异氰尿酸钠、三氯异氰尿酸钠等有氯臭(漂白粉味)的一类消毒剂：新出厂的氯化合物消毒力特别强，但性质不稳定，作用力不持久，见光易分解，必须现配现用。因氯遇水以后，可生成盐酸和次氯酸，所以氯化合物在酸性环境中消毒力较强，在碱性环境下作用力减弱，对金属有一定的腐蚀作用，对组织有一定的刺激性。应用最广泛，商品名称最多的氯化合物是二氯异氰尿酸钠，一般用其0.5-1%溶液杀灭细菌和病毒，用5-10%溶液杀灭芽胞。冬季用量是夏季的3-5倍，作用时间是夏季的5-8倍。
(2)碘与碘化合物：碘酊、碘甘油、复方络合碘、碘伏：碘为灰黑色，极难溶于水，且具有挥发性。碘有较强的瞬间消毒作用，在酸性环境中杀菌力较强，在碱性环境及有机物存在时，其杀菌作用减弱。碘化合物的产品浓度比较低，一般只有1-3%，也有只有0.1%左右的，在现场具体使用时要特别注意消毒液的配比浓度和清除有机物。碘化合物商品名称比较多，在畜牧业上多用碘与表面活性剂络合而成的产物(碘伏)，配比使用浓度视情况为50-150ppm。
三、通过正负电子碰撞原理，即消毒剂所带正电荷能主动吸引和吸附表面具有负电荷的物体，如细菌、病毒蛋白质、墙壁、玻璃、设备、和器具内外表面。正负电子相吸引，使消毒剂分子与细菌、病毒蛋白质接触，产生杀灭作用。如目前广泛使用的季胺盐类阳离子表面活性剂。此类消毒剂能增加病原体细胞膜的通透性，降低病原体的表面张力，引起重要的酶和营养物质漏失，使病原微生物的呼吸及糖酵解过程受阻，菌体蛋白变性，水向菌体内渗入，使菌体破裂或溶解而使病原体死亡，呈现杀菌杀病毒作用。
阳离子表面活性剂抗菌抗病毒谱广，作用快，低浓度不但能杀灭革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌，还对病毒、霉菌、真菌有效。阳离子表面活性剂因其分子结构不同又可分为单链季胺盐类消毒剂和双链季胺盐类消毒剂有些季胺盐无消毒效果如防冻液和油柒中的阳离子表面活性剂等，双链季胺盐的消毒效果一般是单链季胺盐的几倍。双链季胺盐化合物中又因分子结构中碳链的数量和长度不同，消毒效果各不相同。所带碳链多界面活性大而产生极强的吸引力，主动吸引细菌并致其质变死亡。双链季胺盐阳离子表面活性剂又因分子结构中所含卤族类元素不同，消毒效果也不相同，含氯离子的消毒效果较差，以含溴离子的消毒效果最好，最具阳离子表面活性剂的消毒功能。