１ 加强饲养管理
加强饲养管理，可提高畜禽对免疫应激的抵抗能力，保证畜禽有足够的养分以满足机体产生抗体的需要，保障畜禽免疫机能的正常发挥。畜禽体质虚弱、营养不良，高密度饲养，畜舍内有害气体浓度过高；饲喂霉变饲料，感染大肠杆菌病、鸡传染性法氏囊炎、鸡马立克氏病、猪的繁殖与呼吸综合征、圆环病毒病、伪狂犬病等疾病（该类病原可直接侵袭淋巴器官和免疫细胞）；过量或不规范使用抗生素和磺胺类等药物（该类药物可抑制Ｂ淋巴细胞增殖），都可使畜禽免疫应答能力下降，影响免疫效果。
２ 科学选择疫苗品种
目前能在实际生产中应用的疫苗主要有冻干苗（弱毒苗）、油苗（灭活疫苗）、基因工程疫苗。冻干苗能诱导体液免疫和细胞免疫两种免疫反应，接种剂量少，免疫途径多，使用方便，免疫有效期长，劳动强度小，不需添加佐剂，不需浓缩纯化，价格低廉；缺点是具有传染性，处理不当会形成传染源，还可能出现毒力返强，运输、保存和使用要求条件高。油苗分为油佐剂灭活苗和氢氧化铝胶灭活苗，制作工艺简单，易于制成联苗或多价苗；使用安全，无污染，对母源抗体的中和作用弱，使用效果良好，易于保存；缺点是接种剂量大、免疫期短、免疫途径单一、主要激发体液免疫。冻干苗和油苗结合使用，就能达到安全和长效的免疫效果。基因工程苗具有针对性强、免疫力强、安全性高、应激性小、不易返祖、可以区别主动免疫与自然感染的优点；缺点是价格较贵，需多次免疫。
３ 合理制订免疫程序
制订免疫程序应遵循以下步骤和原则：一要根据当地疫病的流行情况，确定需免疫传染病的种类。二要充分考虑畜禽种类、年龄、饲养管理水平、母源抗体的消长情况，确定疫苗种类。三要根据疫苗的性质、类型和免疫途径等因素，确定预防接种顺序、次数、剂量和间隔时间。
制订免疫程序时，要考虑母源抗体滴度，当母源抗体滴度高时，疫苗会被母源抗体中和而不起作用，因此防疫时间过早，防疫次数过多，效果不一定就好。要根据自场情况，制订合理的免疫程序，不能照搬别地区的免疫程序，即便是该地区其他养殖场的免疫程序也不能照搬。最好能根据抗体检测结果，适时地进行调整。免疫程序一经确定，就要严格执行。当其他养殖场发生疾病时，千万不要马上跟着进行紧急预防，否则会打乱正常的免疫程序，更易造成传染病的发生。
４ 确保疫苗质量
选购疫苗必须坚持以下几项原则：一是选择正规企业且有正规生产批号的产品；二是选择运输、保存条件符合要求的产品；三是选择在有效期内的产品；四是选择感观质量合格的产品，凡瓶口松动、瓶壁破损、疫苗粘壁、失去真空的冻干苗及“三无”产品坚决不能使用；五是选择信誉好、经济实力强的生产、经营企业的产品。
冻干苗最忌反复冻溶，灭活苗不能冷冻保存。买疫苗时，一定要带上保温瓶或保温箱，装好疫苗后必须放些冰块（油苗和铝胶苗除外）。买回去后要立即将冻干苗放到冰箱的冷冻室内，把灭活苗放在冷藏室内。
５ 采取正确的免疫方法
稀释疫苗：马立克氏病疫苗要用专用稀释液，禽霍乱及其联苗用铝胶水稀释，其他疫苗要用灭菌生理盐水或蒸馏水稀释，还要按规定的浓度进行稀释。稀释疫苗和接种疫苗的器械不能与消毒药品接触。疫苗要现配现用，稀释后暂时不用的疫苗要放在阴凉处，最好在２小时内用完。
操作过程中要按规定的剂量使用疫苗，有时为克服母源抗体的干扰，可适当提高接种剂量。要按规定的免疫途径使用疫苗，决不能图省事而随意改变。注射所用针头不能太粗，以防疫苗倒流造成剂量不足。活苗最好在１小时内用完，灭活苗必须在２４小时内用完。注射前应将液体疫苗或稀释好的疫苗充分振荡均匀。用过的空瓶进行无害化处理。对猪群免疫接种，应安排在空腹时进行，动作要快捷、熟练，一头猪一个针头。
其他注意事项：饮水免疫时，要先清洁水槽，且在接种前停水２～３小时，稀释好的疫苗最好在半小时内饮完；稀释疫苗时在水中可添加０．２％的脱脂奶粉；畜禽患病或气温太高时不要接种疫苗，应在较凉爽的时段免疫。鸡群在接种疫苗前后１周内，不要断喙、转群；产蛋高峰期的鸡最好不采用抓鸡的方法进行免疫。
６ 做好免疫异常反应的防范措施
如接种时导致接种部位红肿，引起局部淋巴结肿大、嗜睡、呕吐等严重过敏反应的，要立即用肾上腺素、地塞米松等抗过敏药物抢救。如注射部位发生红肿、热、痛等炎性反应，或伴有低烧、呕吐等全身反应，一般不需处理，１～２天可自行消退。
接种禽霍乱活菌苗、链球菌及猪喘气病等疫苗时，免疫前３天后７天内不得使用抗菌药物。接种病毒性疫苗时，在前２天和后３天，其饲料中添加抗生素，以防免疫接种应激引起其他细菌感染；各类疫菌苗接种前后都应在饲料或饮水中添加维生素、葡萄糖等抗应激产品。