蛋壳着色程度受下列一些因素影响，如遗传、环境、健康状况等因素。
　　（1）蛋壳的颜色依赖于附在其上面的嘌呤色素。这种色素主要由子宫部分泌，附在蛋壳外层的胶膜上，蛋壳的钙化一结束，蛋壳的色素也即刻形成。
　　（2）不同品种的褐壳蛋鸡，其蛋壳颜色的深浅相差很大，这主要是与品种的遗传因素有关，与饲料成分的变动无关。
　　（3）环境的影响：冬季蛋壳颜色较深，春夏季节，蛋壳的颜色较浅。
　　（4）与产蛋鸡的日龄有关：刚开产的时候，颜色较深，随着产蛋量的增加，褐色变浅。到了产蛋后期，壳色变浅。
　　（5）疾病的影响：鸡新城疫和传染性支气管炎等呼吸系统疾病，对蛋壳的颜色和蛋壳的质量有严重的影响，当然这些病发生后，严重影响了子宫分泌功能，不仅蛋壳颜色褪色，由红壳蛋变为白壳蛋，而且软皮蛋和破壳蛋也大为增加。某些球虫病的预防药也会导致蛋壳变白。
　　综上所述，褐壳蛋颜色与饲料成分无关，企图改变饲料中的某些成分来改变蛋壳颜色，往往收效不大。有的养鸡户，在饲料中加入一些抗生素后，蛋壳暂时变深，这可能与消除了子宫炎症所致。